幼兒結膜炎一般表現為眼睛發紅、干澀、癢、痛、有異物感、灼燒感、眼瞼沉重感、分泌物較多，當病變累及角膜時，還可出現畏光、流淚以及不同程度的視力下降。同時，部分患兒會伴隨咳嗽、打噴嚏、發熱和腹瀉，根據結膜炎的類型有不同的全身伴隨癥狀。 通常結膜充血越靠近眼瞼穹窿部越明顯，而不同類型結膜炎的分泌物性狀不同。膿性分泌物見于淋球菌感染；黏液膿性分泌物或卡他性分泌物見于細菌性或衣原體性結膜炎；水樣分泌物見于病毒性結膜炎；可拉成絲的分泌物常見于過敏性結膜炎。 除了上述兩種常見癥狀以外，結膜還會出現水腫、出血，有天鵝絨樣外觀的乳頭或水泡樣的濾泡。慢性結膜炎可能還會看到有白色瘢痕附在結膜表面，或因為炎癥較重，附著分泌物、細菌或脫落的上皮細胞，形成白色的偽膜，貼在結膜表面。