牙齒上下牙咬合不齊其原因可能很多，具體如下：1、遺傳性因素：基因學上顯示包括結合臨床觀察，可以發現一般有些患者錯頜畸形，多半與遺傳有較大的關聯性，上輩如果牙齒排列不整齊、咬合不齊，一般他的后代咬合不齊的幾率非常高；2、不良的口腔衛生習慣：就有可能會導致牙齒上下牙咬合不齊，例如喜歡用舌頭去頂、去推或者用手掰或者用鉛筆去磨牙齒等各種口腔不良習慣，有這些口腔不良習慣就有可能造成替牙期，這些牙齒出現上下牙咬合不齊。出現這些情況后，建議患者還是盡早地到正規醫院的口腔科或者口腔醫院的口腔正畸科，找專業的口腔正畸醫生進行仔細檢查，根據其牙齒上下牙咬合不齊的病因，給予相應的治療方案。一般多半考慮通過口腔正畸的方法進行相應的治療，就可以將牙齒上下牙咬合不齊的問題得以較好的解決。