治療血栓最好的藥物是抗凝藥物，出現血栓后最關鍵、最基礎的治療是應用抗凝藥物。抗凝藥物包括針劑以及口服藥物，其中針劑包括低分子肝素這類的，較傳統的口服抗凝藥為華法林鈉。新型的口服抗凝藥包括各種沙班類藥物，如利伐沙班、阿哌沙班、艾多沙班等都是已經上市的直接作用于凝血因子Ⅹ的抗凝藥。口服的抗凝藥，如比較傳統的華法林鈉，應用起來相對比較麻煩，雖然價格比較低，但是應用起來會受到很多食物和藥物的干擾。比如吃水果蔬菜多一些，維生素C的攝入多一些，對華法林鈉的藥效會產生拮抗的作用，藥勁會明顯下降，達不到抗凝的效果，造成血栓復發。有一些藥物、食物還有協同作用，比如止疼藥、抗生素同時吃，華法林鈉藥勁突然增加，增加得太多會造成自發性的出血。所以沙班類的抗凝藥，新型的口服抗凝藥，受食物、藥物的干擾就會比較小。