外傷以后導致的血栓形成，其治療方法跟一般情況導致的血栓形成的治療方法基本相同。但是有的外傷損傷血管，或者因為骨折損傷而壓迫血管，導致血栓形成。此時血栓形成的治療比較麻煩，不能跟通常的血栓形成同樣治療。首先要把骨折復位、損傷的血管修復，其次通過其他的治療方法治療血栓。一般來說，治療血栓的主要方法是抗凝和溶栓，必要時可以通過手術的方法來去除血栓。手術方法包括傳統的方法取栓，以及微創方法將血栓吸除。有的血栓通過手術也不能去除，可能還需要加強藥物治療。如果血栓不穩定，則有導致肺栓塞的風險，可能需要在下腔靜脈放一個下腔靜脈的濾網，防止血栓脫落以后而導致危險的后果。