在肺結核晚期，患者可以出現咳嗽、咳痰、咯血、呼吸困難等情況，肺部功能會受到較嚴重的影響。肺結核的細菌可以造成明顯肺臟受損，患者在稍微活動后會自覺氣不夠用，甚至在不活動的情況下也會出現喘息，稱之為氣短。若結核菌病灶侵犯肺部血管，血管破裂后患者會表現為咯血，甚至有時由于血塊較大，堵塞呼吸道而導致窒息。此外，肺結核菌不僅局限于肺部，也可以在身體中游走。若轉移至腦部，可以引起腦膜炎、結核瘤等。若轉移至泌尿系統，則可出現腸結核等，不及時治療可能會導致較為嚴重的后果。