患者頭頂里一陣一陣痛，主要原因具體如下：1、原發性頭痛：一般是指的顱內沒有特殊疾病，導致的原發性或特發性頭痛，如偏頭痛、緊張性頭痛等，均可以表現為是一陣一陣的疼痛；2、繼發性頭痛：可以繼發于全身系統性的疾病，如發燒、高血壓病、抑郁癥等可以引起頭痛；亦可以繼發于顱內、外器質性的疾病，如顱內的炎癥、腦炎、腦膜炎、血管病、腦出血、蛛網膜下腔出血，或頭部外傷、硬膜下血腫，腦腫瘤、靜脈竇血栓形成，導致的高顱壓狀態等，均會出現頭頂一陣陣的痛。若出現持續不能好轉的頭痛，患者應及時到醫院就診。