近年來，隨著診斷能力、早期干預、康復訓練質量的提高，自閉癥兒童的預后也在逐步改善。部分兒童的認知水平、社會適應能力和社交技巧都可以達到正常水平。但是自閉癥的預后也受到多種因素的影響，包括： 1、診斷和干預的時間，比如早期診斷并在發育可塑性最強時對患兒進行長期系統的干預，一般在6歲以前，可最大程度改善患兒預后。對于輕度、正常或接近正常兒童的自閉癥患兒，早期診斷和早期干預尤為重要； 2、早期語言交流能力，與兒童孤獨癥密切相關。早期在5歲以前，在診斷為兒童自閉癥之前已有較好的語言能力者，預后一般較好； 3、病情嚴重程度以及智力水平。兒童孤獨癥患兒的預后受病情嚴重程度和智力水平影響較大，病情越嚴重，智力越低，預后也越差。反之，病情越輕，智力越高，預后越好； 4、自閉癥患兒是否伴有并發癥。自閉癥兒童的預后還與兒童的發病疾病相關。若患兒伴有脆性X綜合征、結節性硬化、精神發育遲滯、癲癇等疾病，其預后也較差。