膿腫手術后恢復時間與膿腫的部位、深淺、范圍、大小以及手術方式有關，比如肝臟膿腫需要穿刺引流，膿腫較小的需要1-2周，大的需要1個月。其他的膿腫比如肛周膿腫，如果范圍很深，切開引流需要1個月甚至更長的時間，如果是深度比較深進行掛線引流及其它根治性手術，因為是污染區的手術，要完全好時間都比較長，需要1-2個月的時間。如果是其他部位的膿腫，需要根據病變部位、手術方式、有無系統性疾病、患者營養狀態，以及疾病對消炎藥敏感性等眾多因素，決定手術后恢復期需要多長時間。