臨床上，耐藥性結核病是否可根治主要與患者的耐藥情況、患者的基礎疾病、患者的肺部病變情況及患者能否堅持規律服藥有關。 一般情況下，單耐藥的肺結核患者治療效果較佳，而對于耐多藥的肺結核患者，國際上的治愈率約為50%。廣泛耐藥的肺結核患者，其治愈率僅約為20%，絕大部分患者最終只能帶菌生存，如果情況惡劣則會導致患者死亡。 評價耐藥性肺結核是否可根治，除與耐藥性密切相關外，還與患者年紀、身體素質、肺部病變嚴重情況及患者是否規律地服藥，是否合并糖尿病、免疫系統疾病等密切相關。