結石早期沒有明顯癥狀，如果結石在輸尿管里形成梗阻，局部造成積水擴張可導致明顯腎絞痛，即腰背部劇烈疼痛。腎里形成結石，如果結石較小，多數不會造成梗阻癥狀，不會引起明顯疼痛。因為腎臟空間較大，結石空間自由度較大可不引起梗阻。結石排到輸尿管后會產生相應癥狀，輸尿管是細長管道，容易在輸尿管形成結石嵌頓，影響腎臟尿液排出導致腎盂內壓力升高，腎被膜擴張會產生劇烈腎絞痛。早期腎結石沒有癥狀，多數小結石可通過體檢進行B超等影像檢查發現。