附件囊腫和卵巢囊腫的區別主要如下：1、附件：附件在女性生殖系統中指子宮附件，即緊靠子宮的組織，子宮兩側宮角各有一側輸卵管和卵巢，包括輸卵管和卵巢。附件囊腫除卵巢囊腫以外，還包括輸卵管囊腫，常見的為輸卵管泡狀附件以及輸卵管系膜囊腫，所以附件囊腫范圍要大于卵巢囊腫；2、卵巢囊腫：范圍僅為卵巢囊腫，也是常發生的囊腫，包括生理性和病理性。生理性卵巢囊腫通常經過數個月觀察可能消失。病理性卵巢囊腫包括上皮性、性索間質、生殖細胞，還有轉移性的卵巢腫物。此外還有盆腔子宮內膜異位導致的卵巢巧克力囊腫，主要是由于子宮內膜逆行，經血逆流所致，通常會引起痛經等表現。