通常不建議多囊卵巢綜合征患者進行手術治療，早年治療多囊卵巢綜合征的卵巢打孔術，在臨床實際應用中效果不佳且易造成盆腔粘連、損傷卵巢皮質，導致卵巢功能減退，因而不建議患者通過手術治療。實際多囊卵巢綜合征給育齡期女性造成的最大危害在于不孕，但除手術外可以通過促排卵進行改善。糾正患者異常的內分泌狀態后，可以給予克羅米芬或來曲唑等口服促排卵藥物治療。對于部分較難治性的多囊卵巢綜合征患者而言，口服促排卵藥物可能不會產生優勢卵泡，此時可以加用注射用尿促性素等促性腺激素予以治療。通常在口服促排卵藥物和加用尿促性素的治療下，多數患者可以有優勢卵泡發育且排卵率在80%-90%。若經過促排卵治療數周期仍無法懷孕或同時合并有其他不孕因素，此類患者可以選擇試管嬰兒等助孕治療。