肛瘺手術的住院時間需根據肛瘺的復雜程度決定，一般情況下住院1周，但有一些低位單純性小肛瘺也可以2、3天出院。有一些高位復雜性肛瘺可以延長到10天左右。 肛瘺術后要住院，如果有明顯的炎癥要注射抗生素，手術醫生每天要觀察創面換藥，一般出院的標準是創面里面沒有明顯的炎性組織，沒有壞死組織，肉芽比較新鮮，一般就會讓病人出院。 但是出院以后不可以馬上工作，還要在家休息，需保證局部創面透氣，還要在家每天換藥。一般出院隔幾天以后還要到醫院復查，主管大夫會根據創面情況指導進一步護理，如果必要的時候可能還需要創面的再次修整。