懷孕40天可以藥物流產，因為懷孕40天如果月經周期規律，B超已經可以看到宮內妊娠，可以服用藥物流產。孕婦應在醫生指導下服用米非司酮和米索前列醇，需避免陰道出血量多于月經量，若出現此情況，可請醫生及時幫助處理。藥物流產的前提條件為宮內妊娠，如果懷孕40天宮內看不到明確妊娠囊，宮外也看不到孕囊，需待宮內明確妊娠囊甚至看到卵黃囊才可進行藥物流產。注意流產后避免感染與出血，如果出現感染應及時進行治療。流產1個月內不要進行性生活、盆浴，以避免上行感染的可能。流產后的出血時間超過半個月需及時就診，以防長期慢性出血，增加貧血與感染的風險。