大部分活檢需要打麻醉藥，根據病人的不同部位、不同的活檢，有的部位則較疼，包括重要臟器的活檢。如果不打麻藥，配合術中的操作都有問題。比如肺部的活檢，如果病人動或配合不好，可能影響操作或者出現氣胸等問題，所以需要打麻醉藥，使病人能夠依從性更好，更好地配合術診。如果進行活檢的去除術，不論每個部分的活檢，如頸部、胸部、腹部，以及局部的活檢，都需要進行麻醉。分層浸潤組織，使病人能夠耐受，而且依從性較好，利于術者進行操作，以取得活體組織進行診斷、檢查或者標本去除。有的部位的疼痛比較敏感，還可能需要給予鎮靜麻醉。尤其是兒童或者敏感部位的活檢，需要給予靜脈的鎮痛、鎮靜藥，以配合醫生做好活檢的去除。