治療寶寶便秘的藥物，分為內服藥物和外用藥物，具體如下：一、內服藥物：1、西藥：比如益生菌，主要可以調節腸道菌群、改善腸道功能。一些產酸的益生菌，如乳酸桿菌、雙歧桿菌、鼠李糖乳桿菌等，一方面能調整腸道的菌群，改善大便的性狀，另一方面可以產酸，促進腸道運動來緩解便秘。還有一些能夠軟化大便，通過滲透性腹瀉，比如乳果糖、山梨醇以及硫酸鎂，有軟化大便、導瀉的作用；2、中藥：比如同仁堂的小兒化食丸，還有小兒的一些潤腸口服液、小兒秘通口服液等治療便秘的藥物，還有槐杞黃顆粒等，具有通便的功效。二、外用藥物：如開塞露，當大便都塞在肛門門口的時候，這時候要人工輔助通便，可以用開塞露，一方面能軟化大便，另一方面也能刺激腸運動，促進排便。還有一些促進腸蠕動的藥物，如果寶寶胃腸運動功能弱，可以用一些促進腸蠕動的藥。當然在治療便秘的時候，尤其是對生理性的便秘，要從良好的飲食習慣和排便習慣來解決，這是治療便秘的根本。在解決了飲食習慣和排便習慣的基礎上，在醫生的指導下給予一些藥物的治療。一般可能就是用益生菌或者是乳果糖，只有糞便塊堵塞在肛門的門口，形成糞便塊梗死的時候，才用外用的開塞露來進行通便治療。對于頑固性的便秘，一定要到醫院就診，尋找引起便秘的病因，來對因治療。