隱睪術后睪丸萎縮，隱睪本身可能存在睪丸發育不良，特別年紀稍大兒童手術時，睪丸發育不良情況可能更嚴重。若小時候即出現睪丸發育不良，術后同樣可能出現睪丸發育不良。部分兒童術后陰囊外觀較大，但并非可能為睪丸組織，可能混雜其它組織。但是隨著組織水腫消退后，陰囊即會相應縮小，因睪丸本身萎縮、組織，可通過B超進行觀察。 因此，隱睪術后睪丸萎縮，可能睪丸本身較小，且將逐漸變小。如果睪丸并未萎縮，即提示本身發育不良，術后可能逐漸好轉。如果兒童睪丸萎縮，最主要可能即本身兒童精索血管可能發育不好，甚至需進行后期手術。只要正確操作，出現萎縮率較低。操作手法不當，可能出現萎縮率較高。