食道超聲檢查心臟的意義在于可以看清部分經胸超聲看不清楚的切面，有助于觀察非典型切面中是否有異物。通常要求心房顫動的患者，在電復律之前進行食道超聲，因為需要明確左心耳內或者左房內是否有血栓。如果患者體型比較肥胖，合并有肺病、聲窗欠佳時，在經胸超聲上看不清楚左房是否有血栓，更看不清楚左心耳是否有血栓。通過食道超聲，可以從食道后面觀察心臟，因為距離比較短，又沒有肺的遮擋，所以圖像清楚可以看到左房、左心耳里是否有血栓，從而決定下一步診療方案。如果有血栓，則必須經過4周抗凝，血栓消除以后，才能進行電復律治療或者射頻消融治療。如果沒有血栓，24小時之內則可進行手術操作，所以食道超聲對于明確左心耳是否有血栓非常重要，還可以發現不典型房間隔缺損。