呼吸道感染需根據感染的病原體進行相應治療。呼吸道感染最常見的是普通感冒，其次在流感季節出現呼吸道癥狀，比如發燒、咳嗽、流鼻涕等，要考慮流感可能性。病毒感染引起呼吸道癥狀，大部分可以自愈，只需要對癥治療，不建議用抗生素，也不建議用抗病毒的藥物，大部分感染會在一周內自愈。如果有發熱、頭痛等癥狀時，布洛芬、對乙酰氨基酚均有較好的解熱鎮痛作用。如果出現鼻塞、流涕等癥狀，可以使用康泰克或者泰諾等治療感冒癥狀。如果伴有咳嗽、咳痰等癥狀，可以使用鎮咳化痰的藥物。 如果考慮細菌感染引起的呼吸道感染，應使用抗生素。臨床若遇到發燒超過5天，且進行血常規檢查，白細胞、中性粒細胞升高，尤其是C反蛋白升高特別明顯時，要考慮細菌感染，推薦使用頭孢類的抗生素治療呼吸道細菌感染，18歲以上的成人還可以使用左氧氟沙星治療呼吸道感染。兒童可以使用頭孢類或者阿奇霉素類的抗生素，由于呼吸道感染是支原體、衣原體等非典型病原體感染引起，使用阿奇霉素或者氧氟沙星能夠覆蓋到非典型病原體。 此外，對于比較嚴重的呼吸道感染，來不及分析細菌還是病毒時，可以用頭孢類的抗生素聯合阿奇霉素或者氧氟沙星治療。但對于18歲以下的未成年人，不宜使用氧氟沙星等喹諾酮類藥物進行治療。