扁平疣最簡單的治療方法為冷凍、激光等破壞性的方法。但是這種方法往往對皮膚的損傷較大，可以導致皮膚炎癥，或者治療以后色素沉著。首選中藥治療，可以通過內服外洗，從內部提高自身免疫力。因中藥也有抗病毒作用，往往可以治療的更徹底。 扁平疣一般都長在臉上，也有的長在手背上，多發，有大有小，也有些亞臨床癥狀，往往需要多次治療。增生扁平丘疹年輕人多見，部分患者不易治愈。