咳嗽是反流性食管炎常見食管外癥狀，一般是由反流物刺激咽部引起，反流物誤入氣管時可能引起吸入性肺肺炎，甚至肺纖維化。臨床反流性食管炎伴有咳嗽的患者需要進行規律藥物治療，并需要積極干預生活方式。 如果上述兩方面均較好地完成，咳嗽的癥狀持續存在，則需要考慮到是否存在非反流因素。建議到專科檢查，排除咽喉部或肺部疾病。對于反流性食管炎伴有長期咳嗽、哮喘、喉炎患者，經過長期藥物治療如果不緩解，可以考慮外科手術干預進行治療。 研究表明反流可能是20%-40%慢性非特異性咳嗽患者的主要病因。盡管反流已經確定和咳嗽存在相關性，但是如果患者出現咳嗽、哮喘、咽炎等癥狀仍然需要排除其它非反流因素是否存在。