通常少量服用緊急避孕藥，對身體傷害較小，如果反復服用緊急避孕藥，以達到避孕目的，可能會影響女性的月經周期，干擾女性正常的內分泌功能，可能引起不孕。緊急避孕藥含有大量激素，以此達到避孕目的，口服避孕藥激素撤退后可出現撤退性陰道出血，通常不會對身體造成嚴重影響。反復服用緊急避孕藥，攝入大量激素，會干擾正常女性的下丘腦-垂體-卵巢軸的功能，干擾正常的內分泌功能，甚至引起女性內分泌紊亂，發生不孕。部分女性攝入大量孕激素后，可出現頭暈等身體不適反應。