目前甲狀腺功能亢進癥治療藥物主要是兩大類，第一類是咪唑類，即甲巰咪唑，第二類是硫脲類，即丙基硫氧嘧啶。這兩種藥物選用哪種藥物，需要醫生根據患者病情來進行選擇。醫生考慮患者病情時需要考慮患者自身其他的狀況，第一個甲亢的嚴重程度，甲狀腺激素水平情況；第二個患者自身其他狀況，如血象，即血常規有無白細胞減少；第三個肝功能情況，有無肝功能受損。醫生根據甲亢嚴重程度、病因、患者自身其他情況，再選擇使用哪種藥物。一般藥物治療療程以1.5-2年為一個療程，但是由于甲亢是自身免疫性疾病，很多患者通過一個療程不能治愈，可能需要更長時間。尤其是兒童、青少年需要的療程較長，一般兒童、青少年首選甲巰咪唑。妊娠女性，妊娠前3個月一般首選丙基硫氧嘧啶，3個月后可以選擇甲巰咪唑或繼續使用丙基硫氧嘧啶。所以甲亢治療用藥主要根據患者情況進行選擇。