全麻胃鏡、腸鏡一起做應該沒有太大危害，相反在麻醉下，胃鏡、腸鏡一起做可能會節省時間，在一次麻醉的情況下，會把上消化道和下消化道都進行檢查。如果一起做時間相對比單獨做胃鏡或者單獨做腸鏡稍長，另外不論是胃鏡，還是腸鏡檢查，其實都需要在做檢查的時候，通過內鏡向消化道腔內注氣，因為只有通過注氣才能把胃腔打開，把結腸腔打開，才能更好進鏡以及觀察胃腔、結腸腔的情況。如果全麻胃鏡、腸鏡一起做，可能在做完檢查之后，有些人感覺有腹脹，雖然做完胃腸鏡之后，都會在推進的時候進行吸氣過程，但是很難把打進去的氣體完全吸干凈，所以如果胃鏡跟腸鏡一起做，可能相對而言，在檢查之后，出現腹脹的概率會增加。總體而言，全麻下一起做胃腸鏡沒有特別危害，風險不會比單獨做胃鏡或者腸鏡增加。