心肌肥大的治療，需根據引起心肌肥大的病因來進行處理，藥物的選擇也要根據病因來進行選擇，具體如下：1、結構性心臟疾病：左心室的心肌肥大，常見的原因包括主動脈瓣的中重度狹窄、高血壓、主動脈瓣的關閉不全、二尖瓣的關閉不全等。如果有結構性的心臟疾病問題，且有手術指征，則可進行瓣膜置換，改善血流循環的異常，可減少心肌的肥大；2、高血壓：藥物的治療一般是針對早期的心肌肥大的情況，此時可口服一些利尿、強心的藥物來改善癥狀。若是高血壓引起的心肌肥大，一般可控制血壓值、減輕心臟的后負荷，此時可口服一些降壓藥物，包括氨氯地平、卡托普利，以及其他一些相關的降壓藥物來控制血壓。通過服用上述藥物，可減少心肌肥大的發生；3、流出道狹窄：若是右心室心肌肥大，一般主要見于肺動脈瓣狹窄，有時流出道狹窄可造成右心室肥厚。此時需要行肺動脈瓣成形，或右心流出道疏通，進而改善癥狀；4、肺動脈高壓：若是肺動脈高壓引起的心肌肥大，可口服藥物進行治療，主要是西地那非等藥物，還有靜脈應用前列地爾(前列地爾注射液)，也可有效減輕肺動脈的壓力。此外，吸入一氧化氮也可減少肺動脈高壓，進而減輕心肌肥大。因此，心肌肥大的治療，要根據患者的心臟結構異常，還有高血壓、肺動脈壓等情況，來具體選擇藥物。具體治療方式不能一概而論，要結合具體情況進行手術，或選用藥物治療。