多數情況下，腦部病毒感染可以得到較好治療，可以治愈，但需根據病毒感染類型和就診時間早晚決定。現在隨著醫療條件的進步，大多數患者有頭疼、惡心、嘔吐，會及早到醫院治療，所以大部分患者均可以得到有效治療和緩解。極少數的特殊病例，如乙腦。其病毒比較兇險，患者到醫院時已經昏迷，救治的時間比較晚或者診斷時間比較晚，其預后一般不好，有時會出現危及生命的情況，但此類病例比較少見。?多數情況下，一旦有高熱或者說胡話等腦部癥狀的情況下，患者家屬往往就會把患者帶到醫院進行及時救治。總而言之，早期治療對預后也至關重要。