脂肪肝患者會出現肝功能指標異常，脂肪肝分為單純性脂肪肝、脂肪性肝炎、脂肪性肝纖維化、脂肪性肝硬化。單純性脂肪肝通常提示肝功能正常，僅表現為肝臟彩超或CT異常。脂肪性肝炎通常會出現肝功能異常，主要表現為谷丙轉氨酶、谷草轉氨酶、轉肽酶以及堿性磷酸酶升高，嚴重的患者也會出現膽紅素升高。脂肪性肝纖維化或肝硬化的部分患者，也會伴有肝功能異常。對于出現肝功能異常的患者，要積極針對病因治療，若為超重、代謝異常綜合征、高血糖即糖尿病，或高血脂等因素導致，便要降糖、降脂、控制體重，適當增加運動量。針對脂肪肝的病因治療，酒精導致的便要戒酒，藥物誘發的便要停用損肝藥物。若為丙型病毒性肝炎引起的脂肪肝，便要針對丙肝進行抗病毒治療，同時還要進行保肝治療。針對肝功能異常，首先要用抗炎、保肝的藥物，如甘草酸類藥物。當膽紅素升高時，可以應用保肝、利膽的藥物，主要有S-腺苷蛋氨酸、熊去氧膽酸等。