卵巢囊腫和多囊卵巢是完全不同的兩個疾病，所以對女性的影響沒有辦法來比較哪個更嚴重。1、卵巢囊腫：卵巢囊腫對女性的影響主要在于本身屬于增生性疾病，囊腫的性質有可能是良性，也可能是惡性。如果是良性，因為囊腫的存在，囊腫體積過大有可能會導致一側卵巢在急劇活動的時候出現卵巢扭轉。如果是惡性即卵巢癌，卵巢癌和任何一種癌癥一樣，對女性的健康會造成嚴重影響，而且卵巢癌不容易被早期發現，一旦發現容易已經到晚期，所以會出現各種遠處和近處轉移等一系列問題，甚至威脅到女性的生命；2、多囊卵巢：多囊卵巢是以女性的月經改變，不排卵、不懷孕，加上代謝相關的問題為主要臨床表現。不懷孕可以通過誘導排卵、促排卵的方式幫助解決，代謝問題可以通過改變生活方式，使用藥物來解決。多囊卵巢是一個長期慢性持續存在的狀態，只要治療合理，對于女性的健康不會造成威脅。