腦干出血的后遺癥，多數患者可能死亡率會比較高，如果能夠存活的患者，其后遺癥可有： 1、相當多的會是意識障礙，就是長期昏迷； 2、另外可能會出現全身的癱瘓或者偏癱； 3、如有意識的患者也可能出現偏盲或者視覺障礙； 4、記憶力的改變。 腦干出血很少會有完全恢復的患者，但是對于出血量比較少或者是腦干邊緣的少量出血，所講的比較少是指腦干點片狀的出血，就是1ml或者小于1ml出血，此種患者可能會達到完全的恢復。更多的患者會有傳導神經的損傷，包括運動、感覺、語言的障礙。 目前對于腦干出血的治療手段非常有限，腦干出血是最危險的一種腦出血，雖然文獻報道有小部分的患者進行穿刺引流和開顱治療，但是絕大部分的預后并不好或者術后可能暫時緩解，暫時的延長生命的時間，最后的預后也是很差。如果患者出血量超過10ml，無論怎樣救治患者的死亡率都可以達到99%，主要是因為腦干部位神經比較密集，并無有效的辦法進行治療。