多數肝部多發囊腫不嚴重，特別是較小囊腫，通常對身體危害較小。多數屬于單純性肝囊腫，為一種先天性發育異常，或者是后天退行性變引起。單純性肝囊腫不存在癌變風險，生長較緩慢。對于多發囊腫需關注定期檢查，觀察囊腫生長速度以及和其他肝臟占位性疾病進行鑒別診斷，特別是寄生蟲性肝囊腫以及多囊肝，后者屬于常染色體顯性疾病。通常多數多發肝囊腫建議每0.5年復查一次B超，如果直徑超過10cm或存在腹脹、壓迫周圍臟器等癥狀，可以通過微創腹腔鏡下進行肝囊腫開窗引流處理，術后多數患者可以順利康復。