脂蛋白a水平偏低，一般是比較好的情況，脂蛋白a水平增高，和動脈硬化的發生、進展，甚至斑塊的破裂有關。在血脂代謝的過程中，有很多類物質參與，如甘油三酯和膽固醇，其不易溶于水，在血液中移動和轉換時，以脂蛋白作為載體，和脂蛋白結合之后，就可以溶于水，可以在血液里，甚至進行跨細胞膜的轉運。高密度脂蛋白可以把血管壁上的血脂帶回到肝臟，進行清除，可以防治動脈硬化。脂蛋白a類似于低密度脂蛋白，會把膽固醇從肝臟里帶到外周的血管，如果帶到了血管，沉積到血管壁上，可能會形成動脈粥樣硬化的斑塊，如果斑塊越來越大，就會導致管腔狹窄。如果斑塊破裂，有血栓生成，就會出現急性的缺血事件。