肛瘺手術后恢復的時間因肛瘺病情而異，差距較大。比如低位單純性的肛瘺，切開以后可能2周就能長上，但如果是低位復雜性，比如11個瘺管生長起來就比較慢，大概40多天全部長好。高位就更復雜，高位的肛瘺需要進行掛線，用虛實結合掛線的方法，一般掛線20天的時候進行拆線，拆線以后還要長2-4周左右時間，所以大概延續到一個半月才能完全長好。更復雜、更高位的肛瘺可能要長2個月，因為有時外口離肛門較遠，達到臀部整個跨越臀大肌的時候，生長較慢。所以肛瘺愈合時間跨度較大，大概25-30天能夠愈合。