病毒感染患者反復發燒意味著問題沒有解決，即病毒感染沒有清除掉。如EB病毒感染、巨細胞病毒感染，通常容易導致發燒比較久，是因為人體的免疫系統不太好迅速控制住病毒的感染。尤其是當身體免疫系統本身存在一定程度缺陷時，病毒在體內反復繁殖，反復導致身體發炎，導致反復發燒。除病毒本身沒有控制住，導致身體反復發燒，有時也可以分析其它情況，即病毒感染是開始的問題，發燒時病毒感染已經好了，但是在病毒感染的基礎之上，可以并發其它的感染，比如合并了細菌感染。如果不及時控制細菌感染，也可以導致反復發燒。最為常見的情況，如病毒性呼吸道感染，比如病毒感冒或病毒原因導致的支氣管炎。在病變的基礎之上，因為呼吸道已經受損，局部免疫力下降，細菌有時也會趁虛而入。所以如果遇到這種情況，可能要關注的不是病毒感染的問題，而是后續繼發細菌感染問題，及時應用抗菌素非常有必要。