非角化型鼻咽癌晚期癥狀主要分兩大塊，第一是局部癥狀，第二是遠處轉移癥狀。鼻咽腔有6個壁，往上是局部浸潤，也就是侵犯顱底、顱內的癥狀，主要表現為頭痛、惡心、嘔吐，顱神經損害出現聲音嘶啞、吞咽困難、吞咽嗆咳等表現。鼻咽癌往前侵犯會出現鼻塞、鼻阻、鼻血表現。鼻咽癌往口咽侵犯會出現吞咽疼痛、吞咽嗆咳表現。鼻咽癌遠處轉移最容易出現肺、骨、肝等轉移。骨轉移表現為骨痛、病理性骨折；肺轉移會出現咳嗽、咳痰、咳血；肝臟轉移會出現上腹部脹痛、黃疸等表現。 臨床中有些癥狀不會表現出來，有而癥狀也是非典型癥狀。鼻咽癌病史者，有上述癥狀時，要進一步檢查，排除局部侵犯以及遠處轉移的可能。當臨床懷疑有遠處轉移時，比如骨轉移，要做骨掃描進一步明確診斷；懷疑有肺部轉移，要做胸部CT進一步明確診斷；懷疑肝臟轉移，要做肝臟B超、CT或者磁共振，進一步明確診斷。