目前臨床并沒有和莫匹羅星軟膏效果一樣的軟膏，但莫匹羅星軟膏和夫西地酸乳膏、紅霉素軟膏、復方多粘菌素B軟膏的效果類似。莫匹羅星軟膏是局部外用的抗生素，適用于革蘭氏陽性球菌引起的皮膚感染，如膿皰病、癤腫、毛囊炎等原發性皮膚感染，以及濕疹合并感染、潰瘍合并感染、創傷合并感染等繼發性皮膚感染。雖然目前沒有與莫匹羅星軟膏效果一樣的軟膏，但某些外用抗生素的軟膏，如夫西地酸乳膏、紅霉素軟膏、復方多粘菌素B軟膏等可以局部涂抹的外用抗生素，抗菌譜與莫匹羅星軟膏類似，均可適用于革蘭氏陽性菌引起的皮膚感染。但需要注意的是每種軟膏各有特點，如紅霉素軟膏對敏感革蘭氏陽性球菌所致的感染效果較好，而莫匹羅星軟膏和夫西地酸乳膏，除對敏感陽性球菌所致的皮膚感染有效外，還可以對有耐藥性革蘭氏陽性球菌所致的皮膚感染有效果。另外，復方多粘菌素B軟膏除對陽性球菌引起的感染有效外，還對陰性桿菌所致的感染有效，因此適用于混合型細菌所致的皮膚感染性疾病治療。