多粘菌素B軟膏通常指復方多粘菌素B軟膏。莫匹羅星軟膏和復方多粘菌素B軟膏是否一起用，取決于受損皮膚感染的致病微生物類型，通常不建議一起使用。莫匹羅星軟膏和復方多粘菌素B軟膏，雖然都可以用于皮膚表面的感染，但抗菌范圍不同。莫匹羅星軟膏對皮膚感染有關的各種革蘭氏陽性球菌，都有很強的抗菌活性，對耐藥的金黃色葡萄球菌、某些革蘭氏陰性菌，也有一定的抗菌作用，臨床上主要用于對革蘭氏陽性球菌所致的皮膚病、毛囊炎、癤腫等原發性感染的治療。復方多粘菌素B軟膏成分比較多，主要組成成分有硫酸多粘菌素、硫酸新霉素、桿菌肽和鹽酸利多卡因，其抗菌范圍比莫匹羅星軟膏更廣泛。除了對金黃色葡萄球菌有效，還對銅綠假單胞菌、大腸桿菌、嗜血桿菌等革蘭氏陰性的桿菌、各種鏈球菌抗菌活性比較強，對于革蘭氏陰性的球菌和某些放線菌、螺旋體、阿米巴原蟲，也有一定的抑制作用。另外，藥品中還含有鹽酸利多卡因，這是一種局部麻醉藥，可以緩解疼痛，國內批準使用的適應證為預防皮膚割傷、擦傷、燒燙傷、手術傷口等皮膚創面細菌感染，以及臨時緩解疼痛以及不適。因此從抗菌范圍，復方多粘菌素B軟膏抗菌譜比莫匹羅星軟膏更廣泛，適應證各有偏重，通常不建議一起使用。