耳根出現陣發性神經痛，需檢查的科室包括以下方面：1、耳鼻喉科：屬于首診科室，如果專科醫院分得比較詳細，可到耳科就診，醫生會進行外耳道、鼓膜及聽力檢查。若疼痛較劇烈，可能還需進行CT、核磁檢查，明確是否有耳內病變，如中耳炎或外耳道、中耳腫物等，而引起的耳根神經陣發性疼痛；2、口腔科：若耳科檢查未發現明顯異常，可能需到口腔科就診。因為顳頜關節處于耳道前壁，即外耳道前面，如果出現顳頜關節紊亂或顳頜關節病變，也會在張口或使勁咬牙時，表現為陣發性疼痛；3、神經內科：如果口腔科與耳科檢查均未發現問題，可能需要到神經內科就診，明確是否為三叉神經痛。