人體消化道包括口腔、咽部、食管、胃、十二指腸、空腸、回腸、大腸，大腸包括盲腸、升結腸、橫結腸、降結腸、乙狀結腸和直腸，最后到肛門。腸鏡主要檢查大腸，從肛門插管，從直腸、乙狀結腸、降結腸、橫結腸、升結腸，然后緩慢退回檢查大腸。多數患者檢查腸鏡可能不會特別難受，但部分比較敏感、比較瘦弱的患者或者做完婦科手術出現傷口粘連的患者，容易出現疼痛感。患者若比較擔心或者害怕疼痛，可以選擇無痛腸鏡，疼痛感會明顯減輕，基本在睡著狀態下完成檢查。