腸鏡檢查是一個侵入性的檢查，可以引起一定的不舒適感。普通腸鏡檢查包括進鏡到回腸末端回盲部，到了該位置之后再進行退鏡，退鏡時要仔細觀察黏膜。常規而言，如果沒有做過手術，沒有腸粘連等情況，進鏡一般會在幾分鐘之內完成。退鏡要求最少在7分鐘以上，這樣才能仔細觀察腸道的黏膜情況。因此過程如果順利，做腸鏡檢查大概在10分鐘左右可以完成。 如果腹壁做過手術引起腸粘連或體型比較特殊，特別高或特別瘦弱或特別胖，腸鏡的進鏡會出現一定困難，時間可能會延長，有病人可能延長到十幾分鐘都有可能。因此，做腸鏡檢查的時間大概是在15-30分鐘左右，如果時間太長考慮到安全問題，可能會取消腸鏡，進行其他相關檢查方法。