肥厚型心肌病到了比較嚴重的時期，主要是以下幾方面的治療。一、藥物治療：就是針對肥厚型心肌病本身的梗阻治療，肥厚型心肌病末期一般指的都是梗阻嚴重，這個人的活動耐量非常差，甚至于不做任何活動時，都會出現呼吸困難。有的病人會出現走幾步上廁所、吃飯，都會氣喘吁吁、呼吸困難，這就是梗阻很嚴重。梗阻很嚴重時，還是要堅持吃藥，如使用倍他樂克(酒石酸美托洛爾制劑)，這類β阻斷劑去遲緩心肌、減弱心肌收縮率，減少梗阻，這非常重要。二、手術及介入治療：梗阻非常嚴重時，當做超聲心動圖測到的流出道靜息壓差到50mmHg以上時，認為梗阻嚴重。這時非常容易發生猝死，可能考慮做比較激烈的治療，就是外科手術或者是內科的介入治療，將肥厚的心肌變薄。1、外科手術治療：一般是將肥厚的心肌直接切掉，讓流出道的梗阻能夠解除一部分；2、內科介入治療：也就是做化學消融或者射頻消融，讓肥厚的地方變薄。即通過化學消融或者射頻消融，人為的讓肥厚這部分心肌梗死一部分，使其變薄。變薄之后，流出道梗阻就會解除一部分，緩解癥狀，減少猝死的風險。這主要治療是外科和介入手術的治療，讓肥厚的心肌變薄。三、心臟移植：而有人肥厚型心肌病到末期的時候，會出現擴張型心肌病，就是肥厚以后的擴張叫肥厚后擴張、梗阻后擴張。一般其表現就和擴張型心肌病一樣，按照擴張型心肌病去進行治療，最好的結局就是能夠做心臟移植。只要人具備這種條件，做心臟移植可能是最好的轉歸。