肥厚型心肌病一般是不明原因的心肌疾病，治療根據疾病類型確定。肥厚型心肌病一般可分為梗阻型、非梗阻型，非梗阻型早期沒有任何癥狀，沒必要干預。 但梗阻型心肌病，因為心臟射血時，射血越厲害梗阻越厲害，患者具有癥狀時會進行治療，可采取藥物治療，藥物治療不是加強心臟收縮力，因為心臟收縮力越強，梗阻越厲害，治療原則為緩解心臟收縮力，使用減弱心肌收縮的藥物治療。如果梗阻非常嚴重，藥物治療效果不好，可以用化學消融或者電消融，甚至外科開胸消融，把肥厚心肌通過各種人為的消融方法破壞，使心肌壞死，使其失去功能。