甲狀腺切除后可能會導致免疫力下降，但目前無法確定甲狀腺切除是否會對免疫系統造成影響。因為甲狀腺是內分泌器官，它的主要功能是產生、儲存以及分泌甲狀腺激素，但會受到垂體分泌的促甲狀腺激素調節，而垂體又受到下丘腦分泌的促甲狀腺釋放激素調節。所以甲狀腺分泌軸、性腺軸以及糖皮質激素軸存在聯系，甲狀腺被切除后對負反饋的影響可能會影響到糖皮質激素軸以及性腺軸。罹患甲狀腺癌的女性在一段時間后可能會發現乳腺癌，可能與上述因素有關，但具體的機制尚不明確。切除甲狀腺后可能會對其他的內分泌組織產生影響，所以還需要進行進一步的探討，需要進行更多的臨床研究以進一步明確。