賁門胃底癌的突出表現，主要是很多患者表現為進食困難。這種進食困難會進行性加重，還有的患者在進食后可能會出現惡心、嘔吐癥狀。有的患者會出現上腹部的燒灼感，或進食后飽脹不適感，還有的會表現為進食后的隱痛，或疼痛比較劇烈。這些癥狀隨著病情加重會逐漸加重，從剛開始間斷性發生到后期進行性加重、持續性存在。這些癥狀一旦反復出現，要及時做胃鏡等檢查。而由于進食困難以及進食后嘔吐等情況，使患者的飲食量大減，導致很多患者在早期可能就會在短期內出現極度消瘦的癥狀。還有的患者可能會出現發燒或寒戰等臨床癥狀，由于營養不良和消瘦，有的患者會全身乏力導致臥床不起。