肛門刺痛可能與炎癥性疾病相關，還與肛周感覺異常或腫瘤性疾病有關。炎癥性疾病最常見，如肛周膿腫、肛瘺、肛裂等，通常疼痛比較劇烈，甚至伴發熱等全身表現。肛周膿腫處理時，需區分肛周膿腫是否由肛瘺引起。肛瘺是肛門內有一個內口，肛門外有一個外口，兩者之間通過竇道相連。出現肛瘺時肛門疼痛不嚴重，但局部膿腫反復發作、遷延不愈。對于這種疼痛，只有將瘺管完整切開，使新生肉芽組織由內向外生長，才能治愈肛瘺。對于肛周膿腫或肛裂，多數需要進行手術切除。如果肛周出現感覺異常，需注意減少刺激性食物攝入，尤其是辣椒、酒精等，通過減少直腸刺激，可于一定程度緩解刺痛癥狀。