肚臍眼有臭味的主要原因有以下幾種：1、局部衛生差：有的人肚臍眼天生長得比較深，有的人肚臍比較淺，肚臍眼長得比較深的人，污垢容易在肚臍里面積聚，如果長時間不清理就會發生異味，這是最常見的導致肚臍眼有臭味的原因；2、肚臍炎癥：在清理肚臍眼時可能方法不當或者是用力過大，導致皮膚發生破損而感染，這種常見的炎癥稱之為臍炎。多數人是因為在清理肚臍眼過程中方法不當，導致局部皮膚破損，從而發生炎癥感染，肚臍眼發生臭味；3、臍尿管未閉：在胚胎發育、生長時，膀胱到肚臍之間有一條索道相通，在生長發育的過程中索道逐漸閉合，導致大多數人的肚臍和膀胱不相通，中間只有一條已經閉鎖的索道。但是在少見的發育不完善情況下，這條索道沒有完全閉合，所以人的肚臍和膀胱相通，膀胱內尿液有可能進入這條索道而發生感染，之后發生臍炎，這種情況稱為臍尿管未閉。所以如果懷疑有臍尿管未閉，一定要通過影像檢查，比如超聲，如果在下腹部的腹壁上發現臍尿管未閉，需要做相應治療，比如臍尿管切開、引流，這樣臍尿管感染導致的炎癥才能得到控制。