在新型冠狀病毒核酸檢測中，除進行咽部拭子檢測外，亦可進行鼻拭子檢測。對于某些疑似病例，為提高檢測準確性，會同時采集這兩個部位的樣本。值得注意的是，鼻拭子檢測的取樣部位并非一般所理解的鼻孔部位，而是鼻腔深部。檢測時會選用柔軟的長棉簽，該棉簽可穿過鼻前庭、鼻甲并抵達咽腔上部，從頂區取樣，這一過程可能相較咽拭子更為痛苦。在采樣過程中，由于患者的鼻結構異常，如鼻中隔偏曲或鼻甲肥大，可能增加摩擦，導致疼痛、酸爽的感覺或者無法進入深處，則需換用另一鼻孔取樣。由于鼻拭子取樣可能較為痛苦，若能使用局部麻醉噴霧，或許能夠緩解患者的不適，但并不便于普及，因為使用麻醉噴霧后可能需要稍等片刻方可取樣。