卵巢囊腫的病因不同，治療方案也不同，卵巢囊腫的原因與治療有以下幾種：1、生理性囊腫：卵巢上的卵泡或者黃體沒有及時衰退會形成囊腫，但不是腫瘤，通常不需要手術和藥物治療，觀察即可，2-3次月經后，多數囊腫可以消除，消除后就不存在異常；2、良性腫瘤：包括畸胎瘤、巧克力囊腫，都需要進行手術，將異常的囊腫組織剔除，保留良好的組織即可；3、惡性腫瘤：包括卵巢癌，這種情況手術的范圍不僅是切除卵巢，很可能需要切除子宮，甚至需要更廣泛的手術清除才能將病灶完全清除。