自主神經系統不平衡俗稱植物神經功能紊亂，可有心慌、虛汗、小便次數增多，甚至出現心功能障礙。不能與抑郁癥完全劃等號。出現上述癥狀不意味著一定是抑郁癥，但抑郁癥倒可能伴隨有植物神經功能紊亂，合理性更強。植物神經功能紊亂較常見于焦慮癥，癥狀較多，病人就醫的愿望較迫切，多數軀體癥狀也會伴發植物神經功能紊亂。抑郁癥相對癥狀更重，患者通常覺得活著沒有意義，甚至興趣減少、樂趣喪失。所以診斷抑郁癥時需有核心癥狀，并需由神經心理科醫師判斷，做相關檢查才能決定。 植物神經功能紊亂除見于焦慮癥外，還可見于抑郁癥，也可見于其他器質性疾病，如特發性自主神經功能紊亂，為神經變性疾病，可以出現植物神經功能紊亂。其他神經變性病如帕金森病、多系統萎縮也可表現為植物神經功能紊亂。因此導致植物神經功能紊亂的疾病較多，不能直接將自主神經機能不穩與抑郁癥劃等號。