過敏性鼻結膜炎分為兩步治療。過敏性鼻炎常用輔舒良或者糠酸米松這類激素的噴鼻液，過敏性結膜炎常用效果較好、副作用較小的抗菌素滴眼液，如妥布霉素滴眼液，聯合抗組胺藥滴眼液，比如奧洛他定，減少組胺肥大細胞、穩定肥大細胞、減少炎癥介質的釋放。但是臨床上過敏性結膜炎治療效果經常不理想，奧洛他定在少部分病人有效，部分病人應用后效果差強人意。主要是由于炎癥介質以及過敏原沒有完全避免，以及機體內過敏性鼻炎沒有根治。眼表最主要使用的方案是妥布霉素滴眼液預防感染為主，同時可以使用眼表修復液。過敏性鼻結膜炎，根本是在于過敏性鼻炎，過敏性鼻炎引起的過敏性結膜炎。過敏性鼻結膜炎，還有可以進行中醫的治療。另外，提倡大家鍛煉身體、提高體質，改變自身的免疫系統狀態，不要讓機體的免疫系統，處于錯誤應答的狀態，才能根治過敏性鼻結膜炎。