若病人有生育要求，二甲雙胍治療多囊卵巢綜合征可以服用至懷孕。通常多囊卵巢綜合征的病人合并胰島素抵抗，為改善胰島素抵抗，才建議病人口服二甲雙胍，尤其有生育要求的病人，口服二甲雙胍可提高促排卵效率。在生殖科中，多囊卵巢綜合征病人應用二甲雙胍的人數較多，既可改善胰島素抵抗，也可提高促排卵效率。二甲雙胍主要的副作用是胃腸道反應，較少出現其他嚴重反應，如乳酸酸中毒。在生殖科中，服用二甲雙胍的女性患者年齡較輕，并且多數存在生育要求，因此不用過于擔心藥物的副反應。對于胃腸道的不適癥狀，如腹瀉和便秘等，需從小劑量開始適應，逐漸增加至治療劑量。二甲雙胍是B類藥物，即懷孕時服用二甲雙胍對胎兒影響較小，因此不用過于擔心二甲雙胍對胎兒的影響。若病人沒有生育要求，除非存在嚴重代謝異常、過度肥胖、嚴重胰島素抵抗時，一般不建議病人服用二甲雙胍，更多的是建議積極減肥，減輕體重后可改善胰島素抵抗的狀態。二甲雙胍雖然能安全地長期服用，但也建議病人先改變生活方式。